冻干机适用于热敏和受热易变型变性的物质。如生物领域：药品、疫苗、血清、血浆、抗体、微生物、植物提取物等。非生物领域：食品、纳米颗粒、胶体、植物、文物等。冻干机的核心技术就是冻干，也就是冷冻干燥。冻干技术在实际使用过程中相对于常规干燥方法（晒干、煮干、烘干、喷雾干燥等）存在以下优点：
一、冻干一般在低温下进行，因此对于许多热敏性的物质如蛋白质、微生物之类不会发生变性或失去生物活力。
二、在低温下干燥时，物质中的一些挥发性成分损失很小，适合一些化学产品，药品和食品干燥。
三、在冷冻干燥过程中，微生物的生长和酶的作用无法进行，因此能保持原来的性状。
四、由于在冻结的状态下进行干燥，因此体积几乎不变，保持了原来的结构，不会发生浓缩现象。
五、干燥后的物质疏松多孔，呈海绵状，加水后溶解迅速而*，几乎立即恢复原来的性状。
六、由于干燥在真空下进行，氧气极少，因此一些易氧化的物质得到了保护。
七、干燥能排除95-99%以上的水份，使干燥后产品能长期保存而不致变质。

八、由于物料中水分在预冻以后以冰晶的形态存在，原来溶于水中的无机盐类溶解物质被均匀地分配在物料之中。

九、升华时，溶于水中的溶解物质就析出，避免了一般干燥方法中因物料内部水分向表面迁移所携带的无机盐在表面析出而造成表面硬化的现象。